То, что айфон вернулся из сервиса после ремонта микрофона с другими приложениями уже странно. Странный сервис. И не понятно что они там делали с Вашим айфоном.
Можно сделать джеилбрейк системы и установить программку, которая будет через wi-fi передавать все данные Вашего айфона. Я бы сделал резервную копию айфона на компьютере через iTunes и перепрошил айфон, а потом восстановил все данные из копии. Так исключится возможность установки вредоносного ПО
